Очистить swap, при условии, что свободной памяти больше чем занятого свопа можно выполнив от root следуюущие команды:
# swapoff -a && swapon -a
Таким образом вы отключаете все задействованные в системе swap разделы или файлы, заставляя ОС перетянуть все данные в RAM, и включаете обратно, получив на выходе чистый swap.
Спасибо за ценный совет, а то на сервере постоянно swap наполняется, один раз даже переполнился и сервер стал зависать!